Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERBB3P21860 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERBB3P21860 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms