Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
COX6A1P12074 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms