Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
U2AF1L5P0DN76 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
U2AF1L5P0DN76 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms