Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PLIN1O60240 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms