Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CENPBD1B2RD01 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CENPBD1B2RD01 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms