Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EHD3Q9NZN3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EHD3Q9NZN3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EHD3Q9NZN3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EHD3Q9NZN3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms