Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLN6Q9NWW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLN6Q9NWW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLN6Q9NWW5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms