Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF18Q99633 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRPF18Q99633 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF18Q99633 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms