Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf280dQ68FE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Znf280dQ68FE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Znf280dQ68FE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms