Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip13Q3UA06 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trip13Q3UA06 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trip13Q3UA06 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trip13Q3UA06 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms