Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ADE17YMR120C 1779 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 ALR1YOL130W 2580 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 PPT1YGR123C 1542 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 YLR345WYLR345W 1530 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 RRG1YDR065W 1098 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 LSM4YER112W 564 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 SCL1YGL011C 759 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 PHB2YGR231C 933 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 YPR071WYPR071W 636 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 TPN1YGL186C 1740 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 TOM71YHR117W 1920 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BLQ12266 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 GAS1YMR307W 1680 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YDL172CYDL172C 480 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 TFG2YGR005C 1203 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 CLC1YGR167W 702 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YIL082WYIL082W 873 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YKR012CYKR012C 378 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 NYV1YLR093C 762 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 BUR2YLR226W 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 DAP1YPL170W 459 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YPL261CYPL261C 309 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 AVT2YEL064C 1443 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 PTC6YCR079W 1329 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MCM5YLR274W 2328 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ELO2YCR034W 1044 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 PAR32YDL173W 888 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 snR84snR84 550 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 snR86snR86 1004 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RPC25YKL144C 639 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ADH3YMR083W 1128 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 PBI1YPL272C 1554 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SDS24YBR214W 1584 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 DIA4YHR011W 1341 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SHM1YBR263W 1473 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RNH202YDR279W 1053 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 HSP31YDR533C 714 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YER137CYER137C 447 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RTR1YER139C 681 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RNA15YGL044C 891 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 CTF13YMR094W 1437 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MIC27YNL100W 705 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 GLO4YOR040W 858 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 NPT1YOR209C 1290 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 LEA1YPL213W 717 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 AAC3YBR085W 924 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YEF1YEL041W 1488 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MDM31YHR194W 1740 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 PET18YCR020C 648 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YDL162CYDL162C 357 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RCR2YDR003W 633 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 NCS6YGL211W 1080 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 KTI12YKL110C 942 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YKL123WYKL123W 381 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RCN1YKL159C 636 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YLR042CYLR042C 486 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YBL062WYBL062W 381 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 PFK27YOL136C 1194 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ATP20YPR020W 348 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YPR109WYPR109W 885 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ECM18YDR125C 1362 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SPS22YCL048W 1392 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ARH1YDR376W 1482 nt7.3□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SAD1YFR005C 1347 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 BMH2YDR099W 822 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MPO1YGL010W 525 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YHC3YJL059W 1227 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YLR162WYLR162W 357 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MPP6YNR024W 561 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YBR063CYBR063C 1215 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 RPL21AYBR191W 483 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 APA1YCL050C 966 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YLR173WYLR173W 1827 nt7.29□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 NSE3YDR288W 912 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 DMC1YER179W 1005 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YIP5YGL161C 933 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SPO7YAL009W 780 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 ECM1YAL059W 639 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YLR334CYLR334C 381 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YLR402WYLR402W 192 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 AIM34YMR003W 597 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 LTO1YNL260C 597 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YPT11YNL304W 1254 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 GSP2YOR185C 663 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 MRL1YPR079W 1146 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 SLS1YLR139C 1932 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1A-BLQ12266 HST1YOL068C 1512 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 RAD59YDL059C 717 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1A-BLQ12266 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.27□□□□□ -1.25
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