Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 AAT2YLR027C 1257 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 YBR027CYBR027C 333 nt7.07□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 PTK2YJR059W 2457 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 RPN11YFR004W 921 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 TSA1YML028W 591 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 SGF29YCL010C 780 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 ATG22YCL038C 1587 nt7.06□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 YJU3YKL094W 942 nt7.05□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 YKL153WYKL153W 510 nt7.05□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 AMA1YGR225W 1782 nt7.05□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 CLB1YGR108W 1416 nt7.04□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 HGH1YGR187C 1185 nt7.04□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 NAS6YGR232W 687 nt7.04□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 XBP1YIL101C 1944 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 MKK1YOR231W 1527 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 MPC2YHR162W 390 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 YHM2YMR241W 945 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 YNR040WYNR040W 771 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 VHT1YGR065C 1782 nt7.03□□□□□ -1.28
LSP1Q12230 TAL1YLR354C 1008 nt7.02□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 RAD3YER171W 2337 nt7.01□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 CDC34YDR054C 888 nt7.01□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.01□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 LDS1YAL018C 978 nt7.01□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 RVB2YPL235W 1416 nt7.01□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 IMG1YCR046C 510 nt7□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 CCP1YKR066C 1086 nt7□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YPR114WYPR114W 948 nt7□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 MDM31YHR194W 1740 nt7□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 ALD6YPL061W 1503 nt7□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 GUA1YMR217W 1578 nt6.99□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 ATG4YNL223W 1485 nt6.99□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 HSP78YDR258C 2436 nt6.99□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YEL068CYEL068C 333 nt6.99□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 MGM101YJR144W 810 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 HAP3YBL021C 435 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 TAE1YBR261C 699 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 CRF1YDR223W 1404 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 HXT15YDL245C 1704 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 HXT16YJR158W 1704 nt6.98□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 HAL5YJL165C 2568 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YDR187CYDR187C 519 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 CUP2YGL166W 678 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 PHB1YGR132C 864 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 ERC1YHR032W 1746 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 PSR2YLR019W 1194 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 MRPS16YPL013C 366 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YPR196WYPR196W 1413 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 MCM6YGL201C 3054 nt6.97□□□□□ -1.29
LSP1Q12230 YET3YDL072C 612 nt6.96□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 CHO1YER026C 831 nt6.96□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YOL131WYOL131W 327 nt6.96□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 FSF1YOR271C 984 nt6.96□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YLL067CYLL067C 3618 nt6.96□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YER186CYER186C 921 nt6.95□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 CBK1YNL161W 2271 nt6.95□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YEH1YLL012W 1722 nt6.95□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt6.94□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 HAP2YGL237C 798 nt6.94□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 VPS24YKL041W 675 nt6.94□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 RPS2YGL123W 765 nt6.93□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 RPN7YPR108W 1290 nt6.93□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 DIA3YDL024C 1407 nt6.93□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 MAK31YCR020C-A 267 nt6.92□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.92□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YBL070CYBL070C 321 nt6.92□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 PFA3YNL326C 1011 nt6.92□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 SKI2YLR398C 3864 nt6.92□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YHR131CYHR131C 2553 nt6.91□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 YPK2YMR104C 2034 nt6.91□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 ATP1YBL099W 1638 nt6.9□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 HIS7YBR248C 1659 nt6.9□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 RME1YGR044C 903 nt6.9□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 DJP1YIR004W 1299 nt6.9□□□□□ -1.3
LSP1Q12230 HSF1YGL073W 2502 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YIL077CYIL077C 963 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 SCO2YBR024W 906 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 GIT1YCR098C 1557 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 NTE1YML059C 5040 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 UTP4YDR324C 2331 nt6.89□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 HIR1YBL008W 2523 nt6.88□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 UBP13YBL067C 2244 nt6.88□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 RBS1YDL189W 1374 nt6.88□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 CAF40YNL288W 1122 nt6.88□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YEL020CYEL020C 1683 nt6.87□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt6.87□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YBL112CYBL112C 318 nt6.87□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 OSW2YLR054C 2175 nt6.86□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 RAD24YER173W 1980 nt6.86□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YDL057WYDL057W 987 nt6.86□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 YMR252CYMR252C 405 nt6.86□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 TNA1YGR260W 1605 nt6.86□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 PYC1YGL062W 3537 nt6.85□□□□□ -1.31
LSP1Q12230 IDP1YDL066W 1287 nt6.85□□□□□ -1.31
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