Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 FAT3YKL187C 2253 nt5.82□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 VCX1YDL128W 1236 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YLR162WYLR162W 357 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 FSF1YOR271C 984 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 MBF1YOR298C-A 456 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 ECM31YBR176W 939 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YAP1801YHR161C 1914 nt5.81□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YTP1YNL237W 1380 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 OXP1YKL215C 3861 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 EXG1YLR300W 1347 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YHK8YHR048W 1545 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP2tY(GUA)D 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP11tY(GUA)F1 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP6tY(GUA)F2 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP7tY(GUA)J1 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP4tY(GUA)J2 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP5tY(GUA)M1 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP8tY(GUA)M2 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 SUP3tY(GUA)O 75 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YJL193WYJL193W 1209 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 TAL1YLR354C 1008 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 RIB1YBL033C 1038 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 PTH2YBL057C 627 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 GPT2YKR067W 2232 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 MNN2YBR015C 1794 nt5.8□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 ATP1YBL099W 1638 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 RPN11YFR004W 921 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 PIH1YHR034C 1035 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 CDC11YJR076C 1248 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 ERI1YPL096C-A 207 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 ISN1YOR155C 1353 nt5.79□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 GUF1YLR289W 1938 nt5.78□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 TIM22YDL217C 624 nt5.78□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 MAL11YGR289C 1851 nt5.78□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 MRPL23YOR150W 492 nt5.78□□□□□ -1.48
MSH5Q12175 GEX1YCL073C 1848 nt5.77□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 GEX2YKR106W 1848 nt5.77□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 ASH1YKL185W 1767 nt5.77□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 ALT1YLR089C 1779 nt5.77□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YPL277CYPL277C 1464 nt5.77□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RSC2YLR357W 2670 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 PAP2YOL115W 1755 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 MDH3YDL078C 1032 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 CYS3YAL012W 1185 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YKL077WYKL077W 1179 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 GUD1YDL238C 1470 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RET1YOR207C 3450 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 ENT2YLR206W 1842 nt5.76□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 CLP1YOR250C 1338 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RFA1YAR007C 1866 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 SIP2YGL208W 1248 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YRB2YIL063C 984 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 CST26YBR042C 1194 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 MSN2YMR037C 2115 nt5.75□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YEH1YLL012W 1722 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 ARE2YNR019W 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 PYC1YGL062W 3537 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 SCS7YMR272C 1155 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YNR040WYNR040W 771 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 FIT2YOR382W 462 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 SMF2YHR050W 1650 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RNR3YIL066C 2610 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 TFC6YDR362C 2019 nt5.74□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 HSP78YDR258C 2436 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 MFG1YDL233W 1377 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 IDP1YDL066W 1287 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 SOD2YHR008C 702 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YAR064WYAR064W 300 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YOR343CYOR343C 327 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 PAU21YOR394W 495 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 PAU22YPL282C 495 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RGT1YKL038W 3513 nt5.73□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 GUP2YPL189W 1830 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 OPT1YJL212C 2400 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YCK1YHR135C 1617 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 FRS2YFL022C 1512 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 KKQ8YKL168C 2175 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 ASF2YDL197C 1578 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 SET5YHR207C 1581 nt5.72□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 RAD3YER171W 2337 nt5.71□□□□□ -1.49
MSH5Q12175 YDR053WYDR053W 396 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 SNZ3YFL059W 897 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 SNZ2YNL333W 897 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RDL2YOR286W 450 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 UBA1YKL210W 3075 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YJL163CYJL163C 1668 nt5.71□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 IME2YJL106W 1938 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 TRP1YDR007W 675 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 COX20YDR231C 618 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 BCY1YIL033C 1251 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RNH1YMR234W 1047 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YPR076WYPR076W 375 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 RPN7YPR108W 1290 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 ERC1YHR032W 1746 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 UBX2YML013W 1755 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 HSF1YGL073W 2502 nt5.7□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 PDC1YLR044C 1692 nt5.69□□□□□ -1.5
MSH5Q12175 YDL057WYDL057W 987 nt5.69□□□□□ -1.5
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