Protein–RNA interactions for Protein: Q12127

CCW12, Covalently-linked cell wall protein 12, yeastyeast

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCW12Q12127 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YMR295CYMR295C 594 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 MRPL10YNL284C 969 nt4.58□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 ICL1YER065C 1674 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 DAL7YIR031C 1665 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 PYK2YOR347C 1521 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YHR131CYHR131C 2553 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RPE1YJL121C 717 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 VMA4YOR332W 702 nt4.57□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YIL055CYIL055C 1884 nt4.56□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 UTP4YDR324C 2331 nt4.56□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YDL218WYDL218W 954 nt4.56□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 MRC1YCL061C 3291 nt4.56□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 ATG4YNL223W 1485 nt4.56□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 VPS5YOR069W 2028 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 SRY1YKL218C 981 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RNH201YNL072W 924 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 DSF1YEL070W 1509 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 GAT1YFL021W 1533 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YNR073CYNR073C 1509 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 FRE5YOR384W 2085 nt4.55□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 TIM22YDL217C 624 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RPN11YFR004W 921 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YJU3YKL094W 942 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RPL10YLR075W 666 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YNL285WYNL285W 372 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 FSF1YOR271C 984 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 STB5YHR178W 2232 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 CYC8YBR112C 2901 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 HXT2YMR011W 1626 nt4.54□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YBR284WYBR284W 2394 nt4.53□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YER186CYER186C 921 nt4.53□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 HAP2YGL237C 798 nt4.53□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 YEN1YER041W 2280 nt4.53□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RAD24YER173W 1980 nt4.53□□□□□ -1.68
CCW12Q12127 RAD3YER171W 2337 nt4.52□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 VTH1YIL173W 4650 nt4.52□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 VTH2YJL222W 4650 nt4.52□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 NHP6BYBR089C-A 300 nt4.52□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 HSP78YDR258C 2436 nt4.52□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 AFG1YEL052W 1530 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YDL129WYDL129W 876 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RPL7AYGL076C 735 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YHL018WYHL018W 363 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 SUP19tS(UGA)E 82 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 SUP17tS(UGA)I 82 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 SUP16tS(UGA)P 82 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RPS5YJR123W 678 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YLR463CYLR463C 552 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 JNM1YMR294W 1122 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RPL7BYPL198W 735 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 PAT1YCR077C 2391 nt4.51□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 XBP1YIL101C 1944 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 CLB2YPR119W 1476 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 PKC1YBL105C 3456 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YPK2YMR104C 2034 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YER148W-AYER148W-A 579 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 QCR6YFR033C 444 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 PHB1YGR132C 864 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YML018CYML018C 1182 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 CIN4YMR138W 576 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 DAL4YIR028W 1908 nt4.5□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RPS2YGL123W 765 nt4.49□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 LEU5YHR002W 1074 nt4.49□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 DJP1YIR004W 1299 nt4.49□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 QRI5YLR204W 336 nt4.49□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 TAL1YLR354C 1008 nt4.49□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RGD1YBR260C 2001 nt4.48□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 DIA3YDL024C 1407 nt4.48□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 GCV3YAL044C 513 nt4.48□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YLR184WYLR184W 348 nt4.48□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 RME1YGR044C 903 nt4.47□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 DOT5YIL010W 648 nt4.47□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt4.47□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt4.47□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 HAS1YMR290C 1518 nt4.46□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 SKS1YPL026C 1509 nt4.46□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 ERC1YHR032W 1746 nt4.46□□□□□ -1.69
CCW12Q12127 GIT1YCR098C 1557 nt4.46□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 NPA3YJR072C 1158 nt4.46□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 UBP13YBL067C 2244 nt4.46□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 PRI2YKL045W 1587 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 IVY1YDR229W 1362 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 FYV1YDR024W 486 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 LYS12YIL094C 1116 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 ERP2YAL007C 648 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 YJR154WYJR154W 1041 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 YOL131WYOL131W 327 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 ACC1YNR016C 6702 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 YFL042CYFL042C 2025 nt4.45□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 ATP1YBL099W 1638 nt4.44□□□□□ -1.7
CCW12Q12127 IDP1YDL066W 1287 nt4.44□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 22.2 ms