Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SYCNQ0VAF6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SYCNQ0VAF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms