Protein–RNA interactions for Protein: P62869

Elob, Elongin-B, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElobP62869 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ElobP62869 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ElobP62869 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ElobP62869 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ElobP62869 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ElobP62869 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ElobP62869 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ElobP62869 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ElobP62869 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ElobP62869 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ElobP62869 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ElobP62869 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ElobP62869 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ElobP62869 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ElobP62869 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ElobP62869 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ElobP62869 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ElobP62869 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ElobP62869 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ElobP62869 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ElobP62869 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ElobP62869 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ElobP62869 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ElobP62869 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ElobP62869 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ElobP62869 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ElobP62869 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ElobP62869 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ElobP62869 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ElobP62869 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
ElobP62869 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ElobP62869 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ElobP62869 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ElobP62869 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ElobP62869 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ElobP62869 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ElobP62869 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms