Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NcanP55066 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NcanP55066 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NcanP55066 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NcanP55066 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NcanP55066 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcanP55066 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcanP55066 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcanP55066 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcanP55066 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NcanP55066 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NcanP55066 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NcanP55066 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NcanP55066 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NcanP55066 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NcanP55066 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NcanP55066 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NcanP55066 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NcanP55066 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcanP55066 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcanP55066 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NcanP55066 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NcanP55066 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NcanP55066 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NcanP55066 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcanP55066 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcanP55066 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcanP55066 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NcanP55066 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcanP55066 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcanP55066 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NcanP55066 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NcanP55066 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NcanP55066 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NcanP55066 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NcanP55066 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NcanP55066 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NcanP55066 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NcanP55066 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NcanP55066 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NcanP55066 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcanP55066 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcanP55066 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcanP55066 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcanP55066 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NcanP55066 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NcanP55066 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcanP55066 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NcanP55066 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcanP55066 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcanP55066 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcanP55066 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NcanP55066 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NcanP55066 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NcanP55066 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
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