Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
POU3F4P49335 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
POU3F4P49335 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
POU3F4P49335 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 291.3 ms