Protein–RNA interactions for Protein: P17509

HOXB6, Homeobox protein Hox-B6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB6P17509 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB6P17509 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB6P17509 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB6P17509 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 272.8 ms