Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ZNRF3Q9ULT6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNRF3Q9ULT6 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms