Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLKQ9UBT6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms