Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SEMA4BQ9NPR2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SEMA4BQ9NPR2 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms