Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TDRD1Q9BXT4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TDRD1Q9BXT4 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms