Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TREX2Q9BQ50 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms