Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR5

UBE2E2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E2Q96LR5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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UBE2E2Q96LR5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
UBE2E2Q96LR5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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