Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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ZNF248Q8NDW4 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZNF248Q8NDW4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms