Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD54Q6NXT1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ANKRD54Q6NXT1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms