Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNT1Q5JUK3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms