Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CNGA3Q16281 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CNGA3Q16281 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CNGA3Q16281 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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CNGA3Q16281 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CNGA3Q16281 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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