Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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UBE3CQ15386 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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UBE3CQ15386 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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UBE3CQ15386 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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UBE3CQ15386 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
UBE3CQ15386 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UBE3CQ15386 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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