Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CLN3Q13286 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CLN3Q13286 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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