Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TRIM28Q13263 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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