Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FMODQ06828 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FMODQ06828 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FMODQ06828 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms