Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBE3AQ05086 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms