Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
IRF8Q02556 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IRF8Q02556 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms