Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMF1P82094 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMF1P82094 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMF1P82094 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms