Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ATP5C1P36542 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP5C1P36542 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms