Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HOXA10P31260 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HOXA10P31260 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms