Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PEX2P28328 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PEX2P28328 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PEX2P28328 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms