Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MCM3P25205 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms