Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
COL6A2P12110 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms