Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NIPSNAP2O75323 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.1 ms