Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SETD1AO15047 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms