Protein–RNA interactions for Protein: O14813

PHOX2A, Paired mesoderm homeobox protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2AO14813 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PHOX2AO14813 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PHOX2AO14813 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PHOX2AO14813 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PHOX2AO14813 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PHOX2AO14813 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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