Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms