Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RGPD3A6NKT7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RGPD3A6NKT7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms