Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KRT87PA6NCN2 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms