Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MBD5Q9P267 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MBD5Q9P267 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms