Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KIAA1549Q9HCM3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KIAA1549Q9HCM3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms