Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIRIP3Q9BW71 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIRIP3Q9BW71 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms